Năm 1965 -1966 cuộc kháng chiến chống Mỹ cứu nước bước sang giai đoạn quyết liệt. Để đáp ứng những yêu cầu mới của sự nghiệp giáo dục- Trướng cấp 2 Văn Yên ra đời (trên cơ sở tách ra từ trường cấp 2 Lê Lợi).
Hiệu trưởng đầu tiên của nhà trường là cô giáo: Lê Thị Kim Chung, tiếp nối là các cô giáo: Nguyễn Thị Bích Thủy; Bùi NgọcThanh; Bạch Thị Đắc; Nguyễn Thị Chắt.
Vào những năm 1972-1973 trường chuyển sang địa điểm mới (nay là trường Tiểu học Văn Yên)
Năm học 1977-1978 trường cấp 2 Văn Yên được tách thành 2 trường: Trường cấp 2 Văn Yên A và trường cấp 2 Văn Yên B
Năm học 1990-1991 hai trường sát nhập làm một và đổi tên thành trường PTCS Văn Yên sau đổi tên thành THCS Văn Yên do cô giáo Phạm Thị Lý, tiếp đó là thầy Đỗ Huy Mùi; cô giáo Nguyễn Thị Minh Thảo; cô giáo Ngô Thị Xuyên. Và nay là cô giáo Trương Thị Liên làm hiệu trưởng.
Hơn 50 năm đã qua, từ mái trường Văn Yên thân yêu biết bao thế hệ học sinh đã trưởng thành, nhiều em vào THPT đã tham gia các đội tuyển HS giỏi thành phố và HSG quốc gia đạt kết quả cao, thi đỗ vào nhiều trường Đại học. Nhiều HS cũ đã trở thành các nhà khoa học với nhiều học hàm, học vị khác nhau: giáo sư, tiến sĩ, thạc sĩ. Có em đã trở thành các nhà quản lý giỏi, các doanh nghiệp thành đạt. Có thể nói rằng: Các thế hệ học sinh cũ của trường là niềm tự hào, là một phần của lịch sử 50 năm hình thành và phát triển.
Do những phấn đấu không mệt mỏi của thầy cô giáo và học sinh từ thế hệ này sang thế hệ khác, nhà trường đã được Bộ giáo dục và đào tạo, UBND tỉnh Hà Tây (cũ), Sở và PGD tặng nhiều bằng khen, giấy khen. Nhiều năm lền trường được công nhận là đơn vị tiên tiến xuất sắc. Uy tín và niềm tin của nhà trường đã được khẳng định trong phụ huynh và nhân dân địa phương
Các biểu mẫu công khai chất lượng năm học 2023-2024
Thời gian đăng: 27/07/2024
Công văn số 3057/SGDĐT-CTTT-KHCN v/v chủ động ứng phó với cơn bão số 3
Thời gian đăng: 06/09/2024
Quyết định số 4354/QĐ-UBND v/v ban hành khung kế hoạch thời gian năm học 2024-2025 đối với giáo dục mầm non, giáo dục phổ thông và giáo dục thường xuyên trên địa bàn thành phố Hà Nội
Thời gian đăng: 22/08/2024
Quyết định số 2045/QĐ-BGDĐT v/v Ban hành Khung kế hoạch thời gian năm học 2024-2025 đối với giáo dục mầm non, giáo dục phổ thông và giáo dục thường xuyên
Thời gian đăng: 06/08/2024
Kế hoạch 106/KH-PGDĐT v/v Triển khai xây dựng trường học hạnh phúc trong các cơ sở giáo dục trên địa bàn quận Hà Đông
Thời gian đăng: 01/08/2024
Kế hoạch số 105/KH-PGDĐT về việc Tổ chức thực hiện Chỉ thị số 30/CT/TU ngày 19/02/2024 của Ban Thường vụ Thành ủy "Tăng cường sự lãnh đạo của cấp ủy Đảng về xây dựng người Hà Nội thanh lịch, văn minh đến năm 2025"
Thời gian đăng: 16/07/2024